MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 chromosome

Total Repeats: 107792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018877	A	7	7	147	153	100 %	0 %	0 %	0 %	410672378
2	NC_018877	AAGC	2	8	157	164	50 %	0 %	25 %	25 %	410672378
3	NC_018877	CAA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672378
4	NC_018877	GAA	2	6	208	213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672378
5	NC_018877	TAT	2	6	334	339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672378
6	NC_018877	TCC	2	6	373	378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410672378
7	NC_018877	GAT	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672378
8	NC_018877	TTTA	2	8	542	549	25 %	75 %	0 %	0 %	410672378
9	NC_018877	ATC	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672378
10	NC_018877	GAAT	2	8	658	665	50 %	25 %	25 %	0 %	410672378
11	NC_018877	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672378
12	NC_018877	ATA	2	6	684	689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672378
13	NC_018877	TAA	2	6	706	711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672378
14	NC_018877	GAT	2	6	740	745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672378
15	NC_018877	AAG	2	6	777	782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672378
16	NC_018877	GAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672378
17	NC_018877	ACC	2	6	847	852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410672378
18	NC_018877	AGA	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672378
19	NC_018877	TTA	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672378
20	NC_018877	CGC	2	6	921	926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410672378
21	NC_018877	CAAAT	2	10	1014	1023	60 %	20 %	0 %	20 %	410672378
22	NC_018877	TAAT	2	8	1083	1090	50 %	50 %	0 %	0 %	410672378
23	NC_018877	AGC	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672378
24	NC_018877	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672378
25	NC_018877	AGA	2	6	1213	1218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672378
26	NC_018877	A	6	6	1229	1234	100 %	0 %	0 %	0 %	410672378
27	NC_018877	GAA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672378
28	NC_018877	TGG	2	6	1327	1332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672378
29	NC_018877	ACA	2	6	1343	1348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672378
30	NC_018877	A	6	6	1365	1370	100 %	0 %	0 %	0 %	410672378
31	NC_018877	ACT	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672378
32	NC_018877	GAA	2	6	1415	1420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672378
33	NC_018877	AGT	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672378
34	NC_018877	TACAA	2	10	1628	1637	60 %	20 %	0 %	20 %	410672379
35	NC_018877	TCT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672379
36	NC_018877	ACA	2	6	1692	1697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672379
37	NC_018877	GAA	2	6	1734	1739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672379
38	NC_018877	GAA	2	6	1797	1802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672379
39	NC_018877	A	7	7	1877	1883	100 %	0 %	0 %	0 %	410672379
40	NC_018877	AAAAT	2	10	1932	1941	80 %	20 %	0 %	0 %	410672379
41	NC_018877	TTA	2	6	1992	1997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672379
42	NC_018877	GAA	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672379
43	NC_018877	CAT	2	6	2013	2018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410672379
44	NC_018877	TA	3	6	2125	2130	50 %	50 %	0 %	0 %	410672379
45	NC_018877	ATA	2	6	2200	2205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672379
46	NC_018877	TGT	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672379
47	NC_018877	TAAG	2	8	2260	2267	50 %	25 %	25 %	0 %	410672379
48	NC_018877	GAA	2	6	2283	2288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672379
49	NC_018877	TGG	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672379
50	NC_018877	TTA	2	6	2302	2307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672379
51	NC_018877	TAT	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672379
52	NC_018877	TAT	2	6	2341	2346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672379
53	NC_018877	TCT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672379
54	NC_018877	ACA	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672379
55	NC_018877	CAG	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672379
56	NC_018877	AG	3	6	2402	2407	50 %	0 %	50 %	0 %	410672379
57	NC_018877	GA	3	6	2474	2479	50 %	0 %	50 %	0 %	410672379
58	NC_018877	TTC	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672379
59	NC_018877	GAA	2	6	2568	2573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672379
60	NC_018877	AT	3	6	2627	2632	50 %	50 %	0 %	0 %	410672379
61	NC_018877	GATG	2	8	2633	2640	25 %	25 %	50 %	0 %	410672379
62	NC_018877	AGTT	2	8	2672	2679	25 %	50 %	25 %	0 %	410672379
63	NC_018877	ATG	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672379
64	NC_018877	ATT	2	6	2730	2735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672379
65	NC_018877	AATT	2	8	2737	2744	50 %	50 %	0 %	0 %	410672379
66	NC_018877	TACT	2	8	2756	2763	25 %	50 %	0 %	25 %	410672379
67	NC_018877	AAC	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672380
68	NC_018877	AGA	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672380
69	NC_018877	ATG	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672380
70	NC_018877	A	6	6	3141	3146	100 %	0 %	0 %	0 %	410672381
71	NC_018877	AAAC	2	8	3224	3231	75 %	0 %	0 %	25 %	410672381
72	NC_018877	A	6	6	3341	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	410672381
73	NC_018877	TCTTTG	2	12	3355	3366	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410672381
74	NC_018877	A	6	6	3382	3387	100 %	0 %	0 %	0 %	410672381
75	NC_018877	AAC	2	6	3416	3421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672381
76	NC_018877	AT	3	6	3435	3440	50 %	50 %	0 %	0 %	410672381
77	NC_018877	TGA	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672381
78	NC_018877	AGA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672381
79	NC_018877	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672381
80	NC_018877	TTG	2	6	3604	3609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672381
81	NC_018877	A	7	7	3610	3616	100 %	0 %	0 %	0 %	410672381
82	NC_018877	AGA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672381
83	NC_018877	AAG	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672381
84	NC_018877	AAC	2	6	3872	3877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672381
85	NC_018877	TGA	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672381
86	NC_018877	TTC	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672381
87	NC_018877	ACA	2	6	3975	3980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672381
88	NC_018877	ACGA	2	8	3981	3988	50 %	0 %	25 %	25 %	410672381
89	NC_018877	AATT	2	8	4019	4026	50 %	50 %	0 %	0 %	410672381
90	NC_018877	GAT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672381
91	NC_018877	ACG	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672381
92	NC_018877	AACG	2	8	4206	4213	50 %	0 %	25 %	25 %	410672381
93	NC_018877	ATAG	2	8	4231	4238	50 %	25 %	25 %	0 %	410672381
94	NC_018877	AACAAA	2	12	4289	4300	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410672382
95	NC_018877	ATG	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672382
96	NC_018877	GTAT	2	8	4373	4380	25 %	50 %	25 %	0 %	410672382
97	NC_018877	CAC	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410672382
98	NC_018877	ATA	2	6	4433	4438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672382
99	NC_018877	GAA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410672382
100	NC_018877	ATA	2	6	4496	4501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672382
101	NC_018877	A	6	6	4550	4555	100 %	0 %	0 %	0 %	410672382
102	NC_018877	TTA	2	6	4577	4582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672382
103	NC_018877	TCC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410672382
104	NC_018877	TGG	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672382
105	NC_018877	TGGCGG	2	12	4611	4622	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410672382
106	NC_018877	TGG	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672382
107	NC_018877	TGT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410672382
108	NC_018877	GAC	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672382
109	NC_018877	ATTAA	2	10	4900	4909	60 %	40 %	0 %	0 %	410672382
110	NC_018877	AAAG	2	8	4938	4945	75 %	0 %	25 %	0 %	410672382
111	NC_018877	AAC	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672382
112	NC_018877	AAGTTG	2	12	5054	5065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672382
113	NC_018877	ATA	2	6	5114	5119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672382
114	NC_018877	GGT	2	6	5134	5139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672382
115	NC_018877	TTA	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672382
116	NC_018877	GCA	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672382
117	NC_018877	AGC	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672382
118	NC_018877	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672382
119	NC_018877	ATT	2	6	5650	5655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672382
120	NC_018877	ATG	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410672382
121	NC_018877	ATT	2	6	5710	5715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672382
122	NC_018877	TGG	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410672382
123	NC_018877	TTA	3	9	5777	5785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672382
124	NC_018877	TAT	2	6	5825	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410672382
125	NC_018877	TTC	2	6	5836	5841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410672382
126	NC_018877	AAT	2	6	5859	5864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410672382
127	NC_018877	AT	6	12	5874	5885	50 %	50 %	0 %	0 %	410672382
128	NC_018877	CAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410672382
129	NC_018877	A	7	7	5920	5926	100 %	0 %	0 %	0 %	410672382
130	NC_018877	A	6	6	5957	5962	100 %	0 %	0 %	0 %	410672382
131	NC_018877	CCAGC	2	10	5977	5986	20 %	0 %	20 %	60 %	410672382
132	NC_018877	GA	3	6	6020	6025	50 %	0 %	50 %	0 %	410672382
133	NC_018877	GAC	2	6	6048	6053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410672382
134	NC_018877	CGTT	2	8	6070	6077	0 %	50 %	25 %	25 %	410672382
135	NC_018877	CGT	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410672382
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